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C

ClawBio

官方
面向生物信息学的本地优先 AI 技能库
GitHub 源仓库 ↗
★ 1.1k Stars 分类 · 其他 非常热门 源版本 00f070defd3c
63FMRS · C
可靠性
10/20
安全与权限
14/20
维护活跃度
12/20
文档质量
14/20
安装易用性
13/20

来源显示 ClawBio 提供版本 0.6.1 的 PyPI MCP 包和 stdio 配置示例。服务器默认使用演示数据,并提供可选的本地文件访问开关;来源未列出具体 MCP 工具名称。

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ClawBio 是一个面向生物信息学的 AI agent 技能库,覆盖药物基因组学、GWAS、变异解读、祖源分析、单细胞和 RNA-seq。MCP 服务器通过本地 stdio 运行,默认仅使用演示数据,并声明不会将基因组数据发送到机器外部。

工具能力

暂未整理工具清单。

安装接入

安装 Python 3.11+ 后,使用配置中的 uvx 命令接入支持 MCP 的客户端。默认运行演示数据;如需技能读写本地文件,可设置 CLAWBIO_MCP_ALLOW_LOCAL_FILES=1。

claude_desktop_config.json
{"mcpServers":{"clawbio":{"command":"uvx","args":["--from","clawbio[mcp]","clawbio","mcp"]}}}

选型与风险

适合谁

  • 需要本地优先、可复现生物信息学工作流的研究人员
  • 希望让 AI agent 编排已有生物信息学技能的用户
  • 使用演示数据学习基因组分析流程的开发者

不适合谁

  • 需要通用数据库、云存储或浏览器自动化的用户
  • 寻求临床诊断或医疗处方的用户
  • 希望默认直接访问患者基因组文件的场景

所需权限

  • 默认仅运行演示数据
  • 设置 CLAWBIO_MCP_ALLOW_LOCAL_FILES=1 后,技能可读写本地文件
  • 部分技能会访问外部注释、基因组或 Galaxy 服务;具体取决于所调用技能

风险与副作用

  • 药物基因组学和临床变异结果不应替代专业医疗判断
  • 启用本地文件访问后,输入和输出文件可能被技能处理或写入
  • 调用外部 API 或 Galaxy 的技能可能将相关查询或数据发送到外部服务
  • 部分复现需要原始外部输入或外部工具仍然可用

常见排障

  1. 确认已安装 Python 3.11+ 并且 uvx 可用
  2. 检查客户端配置中的命令、参数和 JSON 格式
  3. 先使用默认演示模式验证服务器连接
  4. 如需访问本地文件,确认已设置 CLAWBIO_MCP_ALLOW_LOCAL_FILES=1
  5. 需要外部服务的技能应检查相应服务、工具和凭据是否已配置

使用场景

运行药物基因组学和变异注释分析
查询 GWAS、ClinVar、gnomAD 等基因组数据库
执行祖源 PCA、PRS、单细胞和 RNA-seq 工作流
生成包含命令、环境信息和校验和的可复现分析输出

支持客户端

Cursor部分支持
Zed部分支持
VS Code部分支持
Claude Desktop部分支持